Sezon 1989/1990 (III liga):
1. kolejka: Flota Świnoujście - Arka Gdynia 0:0
20. kolejka: Arka Gdynia - Flota Świnoujście 0:2
Arka po spadku z II ligi rozegrała bardzo słaby sezon, który skończyła zaledwie na 17. miejscu w tabeli. W pierwszych dwóch meczach z Flotą nie udało się Arkowcom zdobyć choć jednej bramki.
Sezon 2000/2001 (III liga):
6. kolejka: Arka Gdynia - Flota Świnoujście 2:2 (Rybkiewicz, Hartman)
25. kolejka: Flota Świnoujście - Arka Gdynia 1:1 (Smarzyński)
W ostatnim sezonie Arki w III lidze to właśnie Flota oraz Warta Poznań rywalizowały z naszym klubem o awans. W obu meczach padł wynik remisowy, a w III lidze grało wówczas aż 21 zespołów i każdy rozegrał po 40 meczów, co dzisiaj jest nie do pomyślenia. W Świnoujściu gole padły w odstępie 60 sekund. Na trafienie Smarzyńskiego odpowiedział Jakubiak. Mecz zapadł jednak w pamięci z powodu zupełnie innych wydarzeń.
Sezon 2011/2012 (obecna I liga):
8. kolejka: Flota Świnoujście - Arka Gdynia 1:0
25. kolejka: Arka Gdynia - Flota Świnoujście 1:1 (Surdykowski)
Pierwszy mecz był pamiętny, dlatego że trener Petr Nemec odesłał po nim do rezerw Wojciecha Wilczyńskiego i Michała Płotkę. Losy tych piłkarzy potoczyły się zupełnie inaczej - "Wilczek" gra dziś w Bytovii, a Płotka w Zniczu. W rewanżu Arka znów miała ogromne problemy, a wyrównującą bramkę zdobył w 88 minucie Janusz Surdykowski.
Sezon 2012/2013 (obecna I liga):
7. kolejka: Arka Gdynia - Flota Świnoujście 0:1
24. kolejka: Flota Świnoujście - Arka Gdynia 3:0
Tym razem Flota pokonała Arkę dwukrotnie. W Gdyni Arka zaprezentowała się w sposób kompromitujący, a po meczu w Świnoujściu odbyły się tradycyjne dla tego miejsca rozmowy z piłkarzami pod sektorem.
Sezon 2013/2014 (obecna I liga):
4. kolejka: Arka Gdynia - Flota Świnoujście 3:0 (Aleksander 2, Marcus)
21. kolejka: Flota Świnoujście - Arka Gdynia 0:1 (Ślusarski)
Po wielu latach udało się przełamać złą passę na Wyspie Uznam. Arka wygrała po akcji Mateusza Szwocha i Bartosza Ślusarskiego. W Gdyni okazała się lepsza aż o trzy bramki.
Bilans meczów Arki z Flotą:
Zwycięstwa Arki - 2
Remisy - 4
Zwycięstwa Floty - 4
Bilans bramek - 8:11